외과적 요법에는 바이러스나 파이토플라스마에 의한 병에는 효과가 없습니다.
또한 각종 부후균과 뿌리썩음병균의 경우 토양에서 발생하여 뿌리 및 여러 유합조직에서 발생하기에 특정 부위에만 외과적 요법을 실시하는 것으로는 치료가 어렵습니다.
게다가 토양의 경우 보통은 과습하고 병원균이 많아 침입 및 번식이 용이하여 약제를 이용하는 것이 효과적입니다